RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		9.26	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		9.26	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF639	Q9UID6	485 aa		9.26	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	VPS4A	Q9UN37	437 aa		9.26	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		9.26	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		9.26	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		9.26	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101		A6NHS1	94 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CLOCK	O15516	846 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SCN2B	O60939	215 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ADAM23	O75077	832 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CLEC3A	O75596	197 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PRSS23	O95084	383 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	FKBP9	O95302	570 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	EGF	P01133	1207 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CEACAM5	P06731	702 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ACP5	P13686	325 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	OXTR	P30559	389 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	AKT2	P31751	481 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	MAGEA8	P43361	318 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	RBBP4	Q09028	425 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	FADD	Q13158	208 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	FGL2	Q14314	439 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	NFATC4	Q14934	902 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PON2	Q15165	354 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	NCLN	Q969V3	563 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PPCDC	Q96CD2	204 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	WDR92	Q96MX6	357 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	MENT	Q9BUN1	341 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SARG	Q9BW04	601 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CHID1	Q9BWS9	393 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	LGR4	Q9BXB1	951 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	EBPL	Q9BY08	206 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	OR1A2	Q9Y585	309 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TRBC2	A0A5B9	178 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PRSS38	A1L453	326 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	KRT87P	A6NCN2	255 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CLIC1	O00299	241 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	MAN2B1	O00754	1011 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	DPM1	O60762	260 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	GUCY1B2	O75343	617 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CREG1	O75629	220 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	IGLV3-19	P01714	112 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	FURIN	P09958	794 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SHMT2	P34897	504 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	GZMM	P51124	257 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	WNT3	P56703	355 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PHC1	P78364	1004 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PRKCQ	Q04759	706 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	VAC14	Q08AM6	782 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SELPLG	Q14242	412 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	KRT33B	Q14525	404 aa		9.24	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		9.24	□□□□□ -0.93

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