RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 WBP2Q969T9 261 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 SLCO4A1Q96BD0 722 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 ULK4Q96C45 1275 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA13Q96N96 652 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 THAP2Q9H0W7 228 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 CARD9Q9H257 536 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 HSD3B7Q9H2F3 369 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 DPEP2Q9H4A9 486 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFP57Q9NU63 452 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 TMOD3Q9NYL9 352 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 DONSONQ9NYP3 566 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 PILRBQ9UKJ0 227 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 TMED7Q9Y3B3 224 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 PCSK5Q92824 1860 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC15A5A6NIM6 579 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TLR4O00206 839 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC28A1O00337 649 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 KLF11O14901 512 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CIDEAO60543 219 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 EDN1P05305 212 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 GPIP06744 558 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 MMP10P09238 476 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 AREGP15514 252 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CLCN4P51793 760 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 GAMTQ14353 236 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 EXT1Q16394 746 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF585BQ52M93 769 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 NEK5Q6P3R8 708 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 GPC2Q8N158 579 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF149Q8NC42 400 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 OR52E1Q8NGJ3 308 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM186Q96B77 213 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 LMLNQ96KR4 655 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM111AQ96PZ2 611 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT23Q9C075 422 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SIX2Q9NPC8 291 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 PANK4Q9NVE7 773 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D13Q9NVG8 400 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 MTMR11A4FU01 709 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM172BPA6NC97 362 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGEB2O15479 319 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TXNL1O43396 289 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 FGF17O60258 216 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF5CO60282 957 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 REC8O95072 547 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CAVIN2O95810 425 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CRYAAP02489 173 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF18P17022 549 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SFNP31947 248 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGEA11P43364 429 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 RABIFP47224 123 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 HUNKP57058 714 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 EVCP57679 992 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CDR2Q01850 454 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 FGD3Q5JSP0 725 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 C19orf48Q6RUI8 117 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 DHRS11Q6UWP2 260 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 MFSD7Q6UXD7 560 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 FCRLAQ7L513 359 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC16A9Q7RTY1 509 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 KDM8Q8N371 416 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX9Q8N6V9 391 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 STPG4Q8N801 248 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 CNNM3Q8NE01 707 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4C3Q8NH37 302 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 OR1L3Q8NH93 324 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-207ENST00000470201 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms