RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP3R2Q96LZ3 170 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF285Q96NJ3 590 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 MS4A8Q9BY19 250 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 NUF2Q9BZD4 464 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 ACPTQ9BZG2 426 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM107BQ9H098 131 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 NPHS2Q9NP85 383 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 FGF21Q9NSA1 209 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 RARRES3Q9UL19 164 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 FRYLO94915 3013 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.96□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A088AWK7 358 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 LRIT2A6NDA9 550 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 EFCAB7A8K855 629 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 B4E171 279 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF195O14628 629 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 DIAPH2O60879 1101 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CSO75390 466 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2B3O76000 313 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PRPH2P23942 346 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPAN7P41732 249 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 RAP1GDS1P52306 607 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PDX1P52945 283 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ARFIP2P53365 341 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 EMP3P54852 163 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGA1P56199 1179 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 HMGCS1Q01581 520 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXM1Q08050 763 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TUBB3Q13509 450 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 IL11RAQ14626 422 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNAB1Q14722 419 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 NR6A1Q15406 480 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR19Q15760 415 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SMU1Q2TAY7 513 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SPIN4Q56A73 249 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 XKR7Q5GH72 579 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 EPGNQ6UW88 154 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZSR9 355 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ABHD13Q7L211 337 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 RGMAQ96B86 450 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TUBGCP3Q96CW5 907 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 QRFPRQ96P65 431 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 HBEGFQ99075 208 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 OR51B5Q9H339 312 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf109Q9NX04 203 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 KNTC1P50748 2209 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP250Q9BV73 2442 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0G2JND7 137 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 FITM1A5D6W6 292 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SDHDO14521 159 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO1DO94832 1006 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM107AO95990 144 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PCSK2P16519 638 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 LBPP18428 481 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MAPK1P28482 360 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 EPHA3P29320 983 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 IDH3AP50213 366 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms