RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 RDH16O75452 317 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 BMP10O95393 424 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SHBGP04278 402 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MMP11P24347 488 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CCND1P24385 295 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 HRH2P25021 359 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CRABP2P29373 138 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 HNF4AP41235 474 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 EMP2P54851 167 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V0D1P61421 351 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 OLR1P78380 273 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC16Q13042 620 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RUNX2Q13950 521 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM53BQ14153 422 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 DOC2AQ14183 400 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NAA25Q14CX7 972 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NADK2Q4G0N4 442 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 DCAF10Q5QP82 559 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF605Q86T29 641 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NT5CQ8TCD5 201 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ATL1Q8WXF7 558 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MIEF2Q96C03 454 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 THAP11Q96EK4 314 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PEX11GQ96HA9 241 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CYTH2Q99418 400 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CD244Q9BZW8 370 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 DRC3Q9H069 523 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR54Q9H977 334 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PELI2Q9HAT8 420 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSS2Q9NR19 701 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 WWOXQ9NZC7 414 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CD274Q9NZQ7 290 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf18Q9UK00 162 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF112Q9ULX5 631 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ACOT9Q9Y305 439 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 COL12A1Q99715 3063 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FREM3P0C091 2139 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF3C1Q12789 2109 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ESPL1Q14674 2120 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TENM4Q6N022 2769 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GTL3 188 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IDSB3KWA1 339 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF223E7ERA6 249 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 H0YIG0 161 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFS4O43181 175 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK8O60259 260 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 KERAO60938 352 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3BGRLO75368 114 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SUPT3HO75486 399 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 STK16O75716 305 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 WFS1O76024 890 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL18O94889 574 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL2O95198 593 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPIND1P05546 499 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 COX6A1P12074 109 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TYK2P29597 1187 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PHBP35232 272 aa6.62□□□□□ -1.35
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