RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454323.1

CUL3-208, Transcript of cullin 3, human

TSL 3

Gene CUL3, Length 688 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-208	ENST00000454323	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	MAPK11	Q15759	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	KDM8	Q8N371	416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	MED30	Q96HR3	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	POLE3	Q9NRF9	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	DAPK1	P53355	1430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	TGFA	P01135	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	KRT19	P08727	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	CKMT2	P17540	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	GCNT1	Q02742	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	DMPK	Q09013	629 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	NFATC4	Q14934	902 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	CALCRL	Q16602	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	MCM10	Q7L590	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	PIGB	Q92521	554 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	BICD1	Q96G01	975 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	PGM2	Q96G03	612 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	CARD9	Q9H257	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM245	Q9H330	911 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL3-208	ENST00000454323	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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