RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 DERL2Q9GZP9 239 aa11.69□□□□□ -0.54
NEK1-201ENST00000439128 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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NEK1-201ENST00000439128 KCNJ13O60928 360 aa11.69□□□□□ -0.54
NEK1-201ENST00000439128 PSMG1O95456 288 aa11.69□□□□□ -0.54
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NEK1-201ENST00000439128 ZNF846Q147U1 533 aa11.68□□□□□ -0.54
NEK1-201ENST00000439128 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 14.1
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NEK1-201ENST00000439128 TBX5Q99593 518 aa11.68□□□□□ -0.54
NEK1-201ENST00000439128 MEAF6Q9HAF1 191 aa11.68□□□□□ -0.54
NEK1-201ENST00000439128 CHD4Q14839 1912 aa11.68□□□□□ -0.54
NEK1-201ENST00000439128 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NEK1-201ENST00000439128 GPR149Q86SP6 731 aa11.68□□□□□ -0.54
NEK1-201ENST00000439128 PDPRQ8NCN5 879 aa11.68□□□□□ -0.54
NEK1-201ENST00000439128 FRS2Q8WU20 508 aa11.68□□□□□ -0.54
NEK1-201ENST00000439128 BRF2Q9HAW0 419 aa11.68□□□□□ -0.54
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