RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CNTFP26441 200 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 GCAP28676 217 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGEA12P43365 314 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 RAPSNQ13702 412 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 XKR6Q5GH73 641 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 PDSS2Q86YH6 399 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 RHEBL1Q8TAI7 183 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC25A23Q9BV35 468 aa23.7■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 KIRREL2Q6UWL6 708 aa23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT78Q8N1N4 520 aa23.69■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 EPB41L4BQ9H329 900 aa23.69■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 SLC22A7Q9Y694 548 aa23.69■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 PDGFAP04085 211 aa23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 HEXBP07686 556 aa23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 EPORP19235 508 aa23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 DOC2AQ14183 400 aa23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 COLEC12Q5KU26 742 aa23.68■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 TCTN3Q6NUS6 607 aa23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 ASB18Q6ZVZ8 466 aa23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF605Q86T29 641 aa23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 FDCSPQ8NFU4 85 aa23.68■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 ALOX12P18054 663 aa23.67■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 IRF8Q02556 426 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 CHIT1Q13231 466 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 HERC3Q15034 1050 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 DEFB134Q4QY38 66 aa23.67■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRD1Q6QNK2 874 aa23.67■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 OR5T3Q8NGG3 340 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 CREB3L4Q8TEY5 395 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 UBTD2Q8WUN7 234 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 C14orf105Q9NVL8 296 aa23.67■■□□□ 1.38
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HTATSF1-202ENST00000425695 OLR1P78380 273 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 HYAL2Q12891 473 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 ABHD13Q7L211 337 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 TEX9Q8N6V9 391 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 OR11G2Q8NGC1 345 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 NACC2Q96BF6 587 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC6A16Q9GZN6 736 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 EHD1Q9H4M9 534 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 PRM3Q9NNZ6 103 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa23.66■■□□□ 1.38
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