RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 DLX3O60479 287 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 HNF4AP41235 474 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CCT5P48643 541 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF844Q08AG5 666 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 LAPTM5Q13571 262 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 E2F2Q14209 437 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PAGE2BQ5JRK9 111 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TRABD2AQ86V40 505 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CCT6BQ92526 530 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ZBTB9Q96C00 473 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ALBP02768 609 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 CRHR1P34998 444 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 AVPR1BP47901 424 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 PIK3CGP48736 1102 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC18A2Q05940 514 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 PCDH1Q08174 1060 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 HYAL2Q12891 473 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 DSG2Q14126 1118 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 NKG7Q16617 165 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SYT16Q17RD7 645 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 VN1R5Q7Z5H4 357 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 PDSS2Q86YH6 399 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 AMER3Q8N944 861 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 TTLQ8NG68 377 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 KLHL31Q9H511 634 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ACTR8Q9H981 624 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKHQ9HCJ1 492 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ACSS2Q9NR19 701 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKDD1BA6NHY2 528 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SGK494L7N484 410 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ERLIN1O75477 346 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SERPINA6P08185 405 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 FOLR3P41439 243 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 UGT8Q16880 541 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 KRT71Q3SY84 523 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 OR2Y1Q8NGV0 311 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 AICDAQ9GZX7 198 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC26A1Q9H2B4 701 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC151A5D8V7 595 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 OR7A17O14581 309 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 RECKO95980 971 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 B3GALT4O96024 378 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 PROCP04070 461 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 CD63P08962 238 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 DEFB109BQ30KR1 87 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 IQCKQ8N0W5 287 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SHISA5Q8N114 240 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 OR52B6Q8NGF0 335 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ZIM3Q96PE6 472 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 CDK15Q96Q40 435 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SPSB2Q99619 263 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR54Q9H977 334 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 H0YIG0 161 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 KLHL18O94889 574 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 UMODP07911 640 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 PCNAP12004 261 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ALOX12P18054 663 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 GSTM2P28161 218 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 CDH13P55290 713 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 RAB8AP61006 207 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 HERVK_113P63132 956 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 OCA2Q04671 838 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 HERC3Q15034 1050 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 DEFB134Q4QY38 66 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 VWA2Q5GFL6 755 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms