RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395038.6

SOS1-201, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOS1, Length 4,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1-201ENST00000395038 ARHGDIAP52565 204 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 NAE1Q13564 534 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 COX20Q5RI15 118 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 WDR34Q96EX3 536 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 VPS35Q96QK1 796 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 DOHHQ9BU89 302 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 REEP1Q9H902 201 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 INIPQ9NRY2 104 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SCN3BQ9NY72 215 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.06□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 KRBA1A5PL33 1030 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 FAM20BO75063 409 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 MOSPD3O75425 235 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SLC16A8O95907 504 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.441e-5■■■□□ 19.1
SOS1-201ENST00000395038 SLC19A1P41440 591 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 LIMS1P48059 325 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 PDE7AQ13946 482 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 CPTPQ5TA50 214 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 CCDC103Q8IW40 242 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 STARD8Q92502 1023 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SGK2Q9HBY8 427 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 HMG20AQ9NP66 347 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 RASSF1Q9NS23 344 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SELENONQ9NZV5 590 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 LILRB5O75023 590 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 LEFTY1O75610 366 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 RECKO95980 971 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 HLA-EP13747 358 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 LAG3P18627 525 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 FUT4P22083 530 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 PDHA2P29803 388 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 RRM2P31350 389 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 GRK3P35626 688 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 GGT2P36268 569 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 LIPAP38571 399 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 ASMTP46597 345 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SELENOWP63302 87 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 IL1RL1Q01638 556 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 CCDC80Q76M96 950 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 NLRP8Q86W28 1048 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SVOPQ8N4V2 548 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 S100ZQ8WXG8 99 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 NEIL2Q969S2 332 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 TPD52L3Q96J77 140 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 PSD2Q9BQI7 771 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 RLIMQ9NVW2 624 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SPINT1O43278 529 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SUV39H1O43463 412 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 FKBP9O95302 570 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SOD1P00441 154 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 VIPP01282 170 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 PSMB9P28065 219 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 HBA1P69905 142 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 CD300CQ08708 224 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 SPIN4Q56A73 249 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 AHSA2Q719I0 299 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 DPPA4Q7L190 304 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 ATL1Q8WXF7 558 aa6.05□□□□□ -1.44
SOS1-201ENST00000395038 TAMM41Q96BW9 452 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms