RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 CTNNB1P35222 781 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 CLDN8P56748 225 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 OR2B6P58173 313 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 VLDLRP98155 873 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 IL18Q14116 193 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 MANEALQ5VSG8 457 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 BORAQ6PGQ7 559 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM25Q86YD3 366 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR150Q8NGU9 434 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 OR10G6Q8NH81 332 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 OR51E2Q9H255 320 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF221Q9UK13 617 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 LATO43561 262 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SERPINB7O75635 380 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 EPHX1P07099 455 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 ADH1AP07327 375 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 EPHA2P29317 976 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 AVPR1BP47901 424 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 PSMD8P48556 350 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 CLCN4P51793 760 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 OLR1P78380 273 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SGCGQ13326 291 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 TUBA3CQ13748 450 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 ATG9BQ674R7 924 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 PLET1Q6UQ28 207 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SBSNQ6UWP8 590 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM129CQ86XR2 697 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 HUS1BQ8NHY5 278 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF675Q8TD23 568 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SERHLQ9NQF3 203 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 GULP1Q9UBP9 304 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 DRGXA6NNA5 263 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 NPPAP01160 153 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 IFI30P13284 250 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 CYBAP13498 195 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 TYRP14679 529 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SHFQ7M4L6 423 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SIX5Q8N196 739 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 KCT2Q8NC54 265 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 PEX13Q92968 403 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF607Q96SK3 696 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC29A3Q9BZD2 475 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SEC16AO15027 2179 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 TLL1O43897 1013 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 GMFGO60234 142 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 RFPL2O75678 378 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 PRLP01236 227 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 CLTBP09497 229 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC15A1P46059 708 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 CCR4P51679 360 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 GRIK2Q13002 908 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 IHHQ14623 411 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 QPRTQ15274 297 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 C17orf99Q6UX52 265 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 SPRED1Q7Z699 444 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 RAB43Q86YS6 212 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD42-202ENST00000393389 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms