RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 NRN1LQ496H8 165 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 GXYLT1Q4G148 440 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 CPZQ66K79 652 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 SFR1Q86XK3 245 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PIGBQ92521 554 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 YIPF5Q969M3 257 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PGAM5Q96HS1 289 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PRRT1Q99946 306 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 VCXQ9H320 206 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PIDD1Q9HB75 910 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 HEY2Q9UBP5 337 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 UPB1Q9UBR1 384 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PISDQ9UG56 409 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 YDJCA8MPS7 323 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ARPC3O15145 178 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 DPM1O60762 260 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 MED6O75586 246 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 IL2RAP01589 272 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PIGRP01833 764 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 GUSBP08236 651 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 CTSAP10619 480 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ELNP15502 786 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PPP3CBP16298 524 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 CEBPBP17676 345 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PTPRAP18433 802 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 UGT1A6P19224 532 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 F8A1P23610 371 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PRKCHP24723 683 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 HOXC9P31274 260 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PRCPP42785 496 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 CCR8P51685 355 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 IRF8Q02556 426 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 SLC13A2Q13183 592 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 NAE1Q13564 534 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PDE7AQ13946 482 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 IER5Q5VY09 327 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 PAQR7Q86WK9 346 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 KMT5CQ86Y97 462 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 AP3S1Q92572 193 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 EME1Q96AY2 570 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 AP2M1Q96CW1 435 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 CERS2Q96G23 380 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 MED10Q9BTT4 135 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ALG12Q9BV10 488 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 EPC1Q9H2F5 836 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ASB7Q9H672 318 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 BCO1Q9HAY6 547 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3-202ENST00000327307 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms