RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322344.7

PNKP-201, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PNKP, Length 2,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-201ENST00000322344 ENPP5Q9UJA9 477 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 NDUFS2O75306 463 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 EPCAMP16422 314 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 MAPK10P53779 464 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 KCNJ10P78508 379 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 PHEXP78562 749 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 IQCCQ4KMZ1 466 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 CATSPEREQ5SY80 951 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.5■■□□□ 1.03
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PNKP-201ENST00000322344 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 TANKQ92844 425 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 UBE2E3Q969T4 207 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 RAD9AQ99638 391 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa21.5■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 PIPSLA2A3N6 862 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 NUDT7P0C024 238 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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PNKP-201ENST00000322344 RBBP4Q09028 425 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 STARD3Q14849 445 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 CRTC3Q6UUV7 619 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 COMMD6Q7Z4G1 85 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 SLC5A11Q8WWX8 675 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 CSF3RQ99062 836 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 PITX2Q99697 317 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 DPEP2Q9H4A9 486 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 TRIM39Q9HCM9 518 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa21.49■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 XPNPEP2O43895 674 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 POU2F2P09086 479 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 CYP4B1P13584 511 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 RAB15P59190 212 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 SLC35A2P78381 396 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 UBE3AQ05086 875 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 DPTQ07507 201 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 PDE7AQ13946 482 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 RAET1GQ6H3X3 334 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 NAGSQ8N159 534 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 FAR1Q8WVX9 515 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 MTERF3Q96E29 417 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 PALMDQ9NP74 551 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 MYNNQ9NPC7 610 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 GPR34Q9UPC5 381 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 PFDN1O60925 122 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 HTR1BP28222 390 aa21.48■■□□□ 1.03
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PNKP-201ENST00000322344 FCHO2Q0JRZ9 810 aa21.48■■□□□ 1.03
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PNKP-201ENST00000322344 C12orf40Q86WS4 652 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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PNKP-201ENST00000322344 OR52N2Q8NGI0 321 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 RORBQ92753 470 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 ARRDC3Q96B67 414 aa21.48■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 HSPBAP1Q96EW2 488 aa21.48■■□□□ 1.03
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PNKP-201ENST00000322344 NOTCH4Q99466 2003 aa21.47■■□□□ 1.03
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PNKP-201ENST00000322344 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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PNKP-201ENST00000322344 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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PNKP-201ENST00000322344 XKR5Q6UX68 686 aa21.47■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 UNC5DQ6UXZ4 953 aa21.47■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa21.47■■□□□ 1.03
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PNKP-201ENST00000322344 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 TRIM74Q86UV6 250 aa21.47■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 PPCDCQ96CD2 204 aa21.47■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.47■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.47■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 RUBCNLQ9H714 662 aa21.47■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 E9PQ18 207 aa21.46■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 PI15O43692 258 aa21.46■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 VEGFDO43915 354 aa21.46■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PNKP-201ENST00000322344 GPR37L1O60883 481 aa21.46■■□□□ 1.03
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