RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 BTBD1Q9H0C5 482 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PSAT1Q9Y617 370 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 LHCGRP22888 699 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PEBP4Q96S96 227 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SIRPGQ9P1W8 387 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 VAMP1P23763 118 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PTCHD3Q3KNS1 767 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 BRAT1Q6PJG6 821 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 THEM6Q8WUY1 208 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PRU2 124 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 A8MV72 311 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC23BQ15437 767 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SGCDQ92629 289 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SUSD3Q96L08 255 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 H0YAE9 185 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 NRP1O14786 923 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 COQ9O75208 318 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 F8A1P23610 371 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF45Q02386 682 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RPA4Q13156 261 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 GXYLT1Q4G148 440 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 DNM1P34Q6PK57 102 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ENPP7Q6UWV6 458 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2AP1Q8NGE2 309 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MMP27Q9H306 513 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SERINC1Q9NRX5 453 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC14L4Q9UDX3 406 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 HCN2Q9UL51 889 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R43P59537 309 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRTM4Q86VH4 590 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF675Q8TD23 568 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MUS81Q96NY9 551 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TIGARQ9NQ88 270 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 LOC100509620A0A075B734 347 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0J9YVX5 310 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 A8MUA0 341 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 EPYCQ99645 322 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MGAT4BQ9UQ53 548 aa23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GVT2 93 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC19A2O60779 497 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RDH12Q96NR8 316 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 KDELR3O43731 214 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 GADD45AP24522 165 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 GRK1Q15835 563 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 UGT8Q16880 541 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TCEANCQ8N8B7 351 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 STOML3Q8TAV4 291 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ALKBH4Q9NXW9 302 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SCML2Q9UQR0 700 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 GBAP04062 536 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTT2P0CG29 244 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MYLK3Q32MK0 819 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF367Q7RTV3 350 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CAMKVQ8NCB2 501 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC5A11Q8WWX8 675 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 NR4A3Q92570 626 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RFPL1O75677 317 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFS1P28331 727 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CLCNKAP51800 687 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TREML1Q86YW5 311 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CNIH3Q8TBE1 160 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PHOX2BQ99453 314 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RASAL1O95294 804 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 POPDC3Q9HBV1 291 aa23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SCDO00767 359 aa23.39■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP2K4P45985 399 aa23.39■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNQ1P51787 676 aa23.39■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.39■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 OR51B5Q9H339 312 aa23.39■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.39■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 POLE4Q9NR33 117 aa23.39■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PRELID1Q9Y255 219 aa23.39■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa23.39■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 HTR1AP08908 422 aa23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms