RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CALHM3Q86XJ0 350 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FAM129CQ86XR2 697 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SMPDL3AQ92484 453 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CNBD2Q96M20 576 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 EHD1Q9H4M9 534 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FEZF1A0PJY2 475 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 H7BY64 318 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 RFXANKO14593 260 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ACTR1BP42025 376 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CCT8P50990 548 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 POLE2P56282 527 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ACTR1AP61163 376 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SIX5Q8N196 739 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SNX19Q92543 992 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HAUS8Q9BT25 410 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ICKQ9UPZ9 632 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 UMPSP11172 480 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 NKG7Q16617 165 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CBR4Q8N4T8 237 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 NELL1Q92832 810 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 RNF145Q96MT1 663 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CHID1Q9BWS9 393 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ELOVL7A1L3X0 281 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 RAB28P51157 221 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PLD3Q8IV08 490 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 WDR48Q8TAF3 677 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 OAZ3Q9UMX2 235 aa20.47■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 LAMA1P25391 3075 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 GABRR3A8MPY1 467 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ACOX3O15254 700 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PCDH7O60245 1069 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PRMT3O60678 531 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 KCNJ13O60928 360 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 MYO1DO94832 1006 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 KLHL18O94889 574 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CD6P30203 668 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PKLRP30613 574 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 C21orf58P58505 322 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CYP4F2P78329 520 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 MICU2Q8IYU8 434 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ANKRD53Q8N9V6 530 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 REPS1Q96D71 796 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SH3GL1Q99961 368 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SH3GL3Q99963 347 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 KLF15Q9UIH9 416 aa20.46■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 DLGAP1O14490 977 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 GSTA4O15217 222 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HSD17B2P37059 387 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 LRRC32Q14392 662 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SPIN4Q56A73 249 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 NRROSQ86YC3 692 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 OR8J2Q8NGG1 315 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FBXO30Q8TB52 745 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.45■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa20.45■□□□□ 0.86
SOX17-201ENST00000297316 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.45■□□□□ 0.86
SOX17-201ENST00000297316 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SOX17-201ENST00000297316 CXCR6O00574 342 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms