RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPN11Q9UMQ6 739 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ACANP16112 2415 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JNJ9 132 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF212BA8MTL3 300 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MVJ9 347 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BMM5 538 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CASKO14936 926 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1I1O60431 355 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SMPD2O60906 423 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFS3O75489 264 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 LY6G6DO95868 133 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GLI4P10075 376 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TPH1P17752 444 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 COMTP21964 271 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 BDKRB1P46663 353 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MAN2A2P49641 1150 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SSR4P51571 173 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH17Q12864 832 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SPARCL1Q14515 664 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 NR1I3Q14994 352 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HERC3Q15034 1050 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 VRK3Q8IV63 474 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP4X1Q8N118 509 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MPP5Q8N3R9 675 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX13Q92968 403 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 NPAS2Q99743 824 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HPF1Q9NWY4 346 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 Q9UFV3 132 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TAC3Q9UHF0 121 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPV9 198 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 URADA6NGE7 173 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MROH6A6NGR9 719 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAPO00193 183 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SUSD5O60279 629 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 AVILO75366 819 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TJP3O95049 919 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FHP07954 510 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 IL1RNP18510 177 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRM3P20309 590 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ADRA1DP25100 572 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMA3P25788 255 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5DP30049 168 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RFC3P40938 356 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PNLIPRP1P54315 467 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DLX5P56178 289 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR85P60893 370 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 Q5PR19 223 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF425Q6IV72 752 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB15Q8WXK1 588 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX11GQ96HA9 241 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC42Q96M95 316 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PCBD2Q9H0N5 130 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM184CQ9NVA4 438 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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