RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291281.8

PRKD2-201, Transcript of protein kinase D2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKD2, Length 3,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2-201ENST00000291281 GPR155Q7Z3F1 870 aa14.85□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 PTOV1Q86YD1 416 aa14.85□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 RBFAQ8N0V3 343 aa14.85□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.85□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 OR51E2Q9H255 320 aa14.85□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 ENGP17813 658 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 SLC15A1P46059 708 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 TAF10Q12962 218 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 FAM26DQ5JW98 314 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 RTP2Q5QGT7 225 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 TMCO6Q96DC7 493 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 OMA1Q96E52 524 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 ABCG4Q9H172 646 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 CDH23Q9H251 3354 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 H3BNC9 293 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 VIPP01282 170 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 CTPS1P17812 591 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 TACR1P25103 407 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 SLC6A4P31645 630 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 HNF1BP35680 557 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 IRF3Q14653 427 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 STARD3Q14849 445 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 SPATC1Q76KD6 591 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 ZBTB2Q8N680 514 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 FLCNQ8NFG4 579 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 TTLQ8NG68 377 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 C7orf34Q96L11 122 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 Q96MT0 163 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 SNX6Q9UNH7 406 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 FPGTO14772 594 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 HMGCLP35914 325 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 GALNT10Q86SR1 603 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 KCNC2Q96PR1 638 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 PANX1Q96RD7 426 aa14.84□□□□□ -0.03
PRKD2-201ENST00000291281 A0A075B6Q4 140 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 H0YC42 278 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 TSPAN3O60637 253 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 PTPRRQ15256 657 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 SHEQ5VZ18 495 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 STX19Q8N4C7 294 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 STMN3Q9NZ72 180 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 ADAM12O43184 909 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 OR5F1O95221 314 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 ICAM2P13598 275 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 PRPS1L1P21108 318 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 TIE1P35590 1138 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 DDOSTP39656 456 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 KCNQ1P51787 676 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 DSC1Q08554 894 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 SP140Q13342 867 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.83□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 TET1Q8NFU7 2136 aa14.82□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.82□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 PRMT3O60678 531 aa14.82□□□□□ -0.04
PRKD2-201ENST00000291281 CLDN11O75508 207 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms