RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ASCL3Q9NQ33 180 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 SNX6Q9UNH7 406 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 PLCL2Q9UPR0 1127 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0J9YVX5 310 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 CDRT15L2A8MXV6 281 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 C9orf172C9J069 976 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 MANBAO00462 879 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 OR1F1O43749 312 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 KRT6AP02538 564 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 KRT6BP04259 564 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 FGF5P12034 268 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINB3P29508 390 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 SLC5A2P31639 672 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 GABRA4P48169 554 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 KRT6CP48668 564 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 FRG2Q64ET8 278 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 GPR135Q8IZ08 494 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD53Q8N9V6 530 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 MFSD9Q8NBP5 474 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 THAP11Q96EK4 314 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 FRG2BQ96QU4 278 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 OR2A5Q96R48 311 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 B3GNT4Q9C0J1 378 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 SYNPO2LQ9H987 977 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 SERTAD3Q9UJW9 196 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 NVLO15381 856 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 GSTM2P28161 218 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 AHRP35869 848 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 HTR6P50406 440 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 ITGA1P56199 1179 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D25Q3MII6 688 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 ADNP2Q6IQ32 1131 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 TTLQ8NG68 377 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 OR1L3Q8NH93 324 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 C10orf82Q8WW14 230 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 FAR2Q96K12 515 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 FCRL4Q96PJ5 515 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 ELOVL6Q9H5J4 265 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 FOXJ2Q9P0K8 574 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 ZFP69BQ9UJL9 534 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-201ENST00000249504 ULK1O75385 1050 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 PCNAP12004 261 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINB1P30740 379 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 ARFIP2P53365 341 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF33BQ06732 778 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 IFT88Q13099 833 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 VN1R5Q7Z5H4 357 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM126BQ8IUX1 230 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRE2Q9UHX3 823 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 DCTN4Q9UJW0 460 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 CEP295Q9C0D2 2601 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0G2JND7 137 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 SERTM1A2A2V5 107 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 ANKDD1BA6NHY2 528 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 SLCO1B7G3V0H7 640 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 HCRTR1O43613 425 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 OR2B3O76000 313 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 CHEK2O96017 543 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 PDYNP01213 254 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 C1QTNF9P0C862 333 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 KITP10721 976 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 PIK3CBP42338 1070 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 NEK2P51955 445 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 FRMPD2BQ6IN97 320 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 VN1R4Q7Z5H5 301 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 RFWD2Q8NHY2 731 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 SELENOMQ8WWX9 145 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 ULBP3Q9BZM4 244 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 TUBB1Q9H4B7 451 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 DKK4Q9UBT3 224 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 VTI1BQ9UEU0 232 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 SDK2Q58EX2 2172 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD11-201ENST00000249504 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms