RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 POT1Q9NUX5 634 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ARL15Q9NXU5 204 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 SLC5A10A0PJK1 596 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 IDO1P14902 403 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CYP2A7P20853 494 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 GDF5P43026 501 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 HNMTP50135 292 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 AP1S2P56377 157 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MC2RQ01718 297 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 BCL7AQ4VC05 210 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 C1orf146Q5VVC0 180 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MIER2Q8N344 545 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 TGM7Q96PF1 710 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 NPAS2Q99743 824 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 AIG1Q9NVV5 245 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 TRPS1Q9UHF7 1281 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 GPR45Q9Y5Y3 372 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF462Q96JM2 2506 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 STMND1H3BQB6 276 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 FBP2O00757 339 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 KCNJ13O60928 360 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 KRT36O76013 467 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PDE5AO76074 875 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 GSTM1P09488 218 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 EPB42P16452 691 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 GNAZP19086 355 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 SLC6A12P48065 614 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 GSTM4Q03013 218 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ART3Q13508 389 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 LY6DQ14210 128 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MANEAQ5SRI9 462 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 REP15Q6BDI9 236 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PAOXQ6QHF9 649 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 Q6ZSR9 355 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 OR9I1Q8NGQ6 314 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ATP6V1E2Q96A05 226 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 RNF31Q96EP0 1072 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 BRINP2Q9C0B6 783 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 WDR41Q9HAD4 459 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 COL6A6A6NMZ7 2263 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MGAT4DA6NG13 374 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 KATNA1O75449 491 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 WDR47O94967 919 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 EBLN1P0CF75 366 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 EPORP19235 508 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 HIST1H2ADP20671 130 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CAPZBP47756 277 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 HTR6P50406 440 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ERVK-8P63133 956 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CYP4F2P78329 520 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PIGGQ5H8A4 983 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 DCAF12Q5T6F0 453 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 HACD2Q6Y1H2 254 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 HPS6Q86YV9 775 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 OR2L2Q8NH16 312 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 STMN2Q93045 179 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 SERPINI1Q99574 410 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 FBXO8Q9NRD0 319 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PILRAQ9UKJ1 303 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 POMPQ9Y244 141 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 BBIP1A8MTZ0 92 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 NRP2O60462 931 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 AMD1P17707 334 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms