RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022507.12

Pspc1-201, Transcript of Paraspeckle component 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pspc1, Length 4,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Klra2Q60660 288 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr58Q7TRF6 309 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Znf473Q8BI67 892 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Clec1aQ8BWY2 269 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Zmiz2Q8CIE2 920 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Prokr2Q8K458 381 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Colec12Q8K4Q8 742 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Spns1Q8R0G7 528 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Abhd6Q8R2Y0 336 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ppp1r8Q8R3G1 351 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pcdha11Q91Y19 950 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rab4bQ91ZR1 213 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pcyox1Q9CQF9 505 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Eif1bQ9CXU9 113 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ttc9bQ9D6E4 239 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Dtwd1Q9D8U7 304 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Nek7Q9ES74 302 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cav2Q9WVC3 162 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm20792A0A087WRF5 222 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm28490A0A087WRT9 222 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Prdm12A2AJ77 365 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 LipcP27656 510 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Htr5bP31387 370 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 PtgirP43252 415 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Il12aP43431 215 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Tspan5P62080 268 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 AnpepP97449 966 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Thoc6Q5U4D9 341 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 SrmsQ62270 496 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ephx4Q6IE26 359 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Spcs3Q6ZWQ7 180 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Q80Y73 168 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Tmem198Q8BG75 360 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Q8CCC3 530 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rftn2Q8CHX7 500 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 PolbQ8K409 335 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Uroc1Q8VC12 676 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr1499Q8VG65 314 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Wdr77Q99J09 342 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Dnttip1Q99LB0 328 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 VasnQ9CZT5 673 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Prl8a6Q9DAY2 240 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Foxe3Q9QY14 288 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Sept5Q9Z2Q6 369 aa11.1□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ctxnd2A0A1B0GQX3 59 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Dmrtb1A2A9I7 359 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Mettl23A2AA28 253 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr1221L7MU53 311 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 NapsaO09043 419 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Tcte3P11985 191 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 PkmP52480 531 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Col28a1Q2UY11 1141 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pdss1Q33DR2 409 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm773Q3TML4 206 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 1700012B07RikQ3V0S8 276 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Tmem199Q5SYH2 208 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Creb3Q61817 404 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ttyh3Q6P5F7 524 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Stoml3Q6PE84 287 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Plekha1Q8BUL6 383 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cdt1Q8R4E9 557 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr450Q8VF81 310 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr697Q8VFM4 317 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr441Q8VFS5 310 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr283Q8VGU2 309 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cldn3Q9Z0G9 219 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Fam84bD3YXJ5 310 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rnf212bD3Z423 297 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gp6P0C191 313 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Mup5P11591 180 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 BpgmP15327 259 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 CratP47934 626 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 GiprQ0P543 460 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gsdmc2Q2KHK6 480 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Q3KNL4 93 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rab34Q64008 259 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Styk1Q6J9G1 429 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr1031Q7TR87 336 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rxfp3Q8BGE9 472 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rrnad1Q8BZG5 475 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Zbtb20Q8K0L9 741 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Nt5mQ8VCE6 220 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr1324Q8VEU7 332 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 TipinQ91WA1 278 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Snx15Q91WE1 337 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 TfQ921I1 697 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rnase10Q9D5A9 208 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ccdc54Q9DAL3 329 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Six6Q9QZ28 246 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Skp1Q9WTX5 163 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pds5aQ6A026 1332 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Mmp2P33434 662 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ptpn11P35235 597 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gng8P63078 70 aa11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 VaspP70460 375 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pdss2Q33DR3 401 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.5 ms