RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625713.2

ARRDC3-AS1-201, ARRDC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ARRDC3-AS1, Length 2,500 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HECTD3Q5T447 861 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SLC24A5Q71RS6 500 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SPATC1Q76KD6 591 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SAPCD2Q86UD0 394 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CLECL1Q8IZS7 167 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CEP19Q96LK0 163 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 EBPLQ9BY08 206 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TRPV5Q9NQA5 729 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PRDM8Q9NQV8 689 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NDUFAF4Q9P032 175 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DUSP12Q9UNI6 340 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DOCK3Q8IZD9 2030 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 FRMPD3Q5JV73 1810 aa12.16□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SH3D21A4FU49 640 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TBKBP1A7MCY6 615 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SLITRK5O94991 958 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 MPC1LP0DKB6 136 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HIST1H2ADP20671 130 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DDOSTP39656 456 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NUDT6P53370 316 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NKX3-2P78367 333 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 FAM189BP81408 668 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 MICAQ29983 383 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RNF130Q86XS8 419 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HIST1H2AJQ99878 128 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 H2AFJQ9BTM1 129 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NDEL1Q9GZM8 345 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SCN8AQ9UQD0 1980 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 C1orf226A1L170 272 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SLC16A5O15375 505 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 COCHO43405 550 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CLDN7O95471 211 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DNTTP04053 509 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TRAPPC2P0DI81 140 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TRAPPC2BP0DI82 140 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ATF6P18850 670 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IDH2P48735 452 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RGNQ15493 299 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PTCHD3Q3KNS1 767 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IFI44LQ53G44 452 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TMC5Q6UXY8 1006 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 KRT73Q86Y46 540 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 C11orf65Q8NCR3 313 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SPPL2AQ8TCT8 520 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SOCS4Q8WXH5 440 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DUSP26Q9BV47 211 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ITM2CQ9NQX7 267 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DYRK4Q9NR20 520 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TMEM184CQ9NVA4 438 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IMPAD1Q9NX62 359 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ENOPH1Q9UHY7 261 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 BTBD3Q9Y2F9 522 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa12.15□□□□□ -0.46
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ZNF840PA6NDX5 716 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 H3BQ06 376 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 H7C4K7 107 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 YY2O15391 372 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 MPZL2O60487 215 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 UGDHO60701 494 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PRAMEF4O60810 478 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NUDT7P0C024 238 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LAMP1P11279 417 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CCR7P32248 378 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HNF1BP35680 557 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SP140Q13342 867 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 GPR50Q13585 617 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LRRC26Q2I0M4 334 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 BCL7AQ4VC05 210 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ANXA8L1Q5VT79 327 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LIPJQ5W064 366 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CAMKMTQ7Z624 323 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NLRP8Q86W28 1048 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ATCAYQ86WG3 371 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LGI4Q8N135 537 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 VPS37AQ8NEZ2 397 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 OR2A14Q96R47 310 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 MGLLQ99685 303 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CCM2Q9BSQ5 444 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 GPR62Q9BZJ7 368 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SMURF1Q9HCE7 757 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 THSD1Q9NS62 852 aa12.14□□□□□ -0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 VPS29Q9UBQ0 182 aa12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms