RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 STK16O75716 305 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR4F21O95013 312 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TFAP2AP05549 437 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GKN3PP0CG01 181 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 S100PP25815 95 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GABRR2P28476 465 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ETV3P41162 512 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR3A3P47888 321 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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CLCN3-211ENST00000613795 OR2L2Q8NH16 312 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLCN3-211ENST00000613795 COPS5Q92905 334 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SGTBQ96EQ0 304 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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CLCN3-211ENST00000613795 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF536O15090 1300 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 POM121CA8CG34 1229 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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CLCN3-211ENST00000613795 CBSP35520 551 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLCN3-211ENST00000613795 E2F1Q01094 437 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FAM189A2Q15884 450 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NTRK2Q16620 822 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 UGCGQ16739 394 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HACD4Q5VWC8 232 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MED27Q6P2C8 311 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CLCC1Q96S66 551 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ACSS2Q9NR19 701 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GLTPQ9NZD2 209 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 F8W036 122 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 INSIG1O15503 277 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LYRM1O43325 122 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MFSD11O43934 449 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PDGFAP04085 211 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PFKMP08237 780 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HSD17B1P14061 328 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 POU2F1P14859 743 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ERVK-25P63136 954 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BLOC1S1P78537 153 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IRF9Q00978 393 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GBE1Q04446 702 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ST3GAL4Q11206 333 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CHST9Q7L1S5 443 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TFAP2CQ92754 450 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.341e-6■■■■□ 21
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CLCN3-211ENST00000613795 PHB2Q99623 299 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLCN3-211ENST00000613795 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NIPAL2Q9H841 368 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ABI3Q9P2A4 366 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLCN3-211ENST00000613795 ALPPL2P10696 532 aa6.67□□□□□ -1.34
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CLCN3-211ENST00000613795 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TPMTP51580 245 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TAS2R39P59534 338 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RAPSNQ13702 412 aa6.67□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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