RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEAD4Q15561 434 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF385BQ569K4 471 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRTC3Q6UUV7 619 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCTLQ6UWM7 567 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa15.85■□□□□ 0.13
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