RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565987.5

NUBP2-208, Transcript of nucleotide binding protein 2, human

TSL 5 BASIC

Gene NUBP2, Length 1,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUBP2-208	ENST00000565987	HIST1H2AD	P20671	130 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CXCR2	P25025	360 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	AVPR1B	P47901	424 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	NR6A1	Q15406	480 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	AMER2	Q8N7J2	671 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	THAP11	Q96EK4	314 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SNX24	Q9Y343	169 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MED13L	Q71F56	2210 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987		A0A1W2PQ72	361 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	BMP10	O95393	424 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	GUCA1C	O95843	209 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CELA2A	P08217	269 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PRR35	P0CG20	571 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	IL1RN	P18510	177 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SAT1	P21673	171 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CCND1	P24385	295 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MGAT5	Q09328	741 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	DUPD1	Q68J44	220 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ASPG	Q86U10	573 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	KCT2	Q8NC54	265 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	OR56A3	Q8NH54	315 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CNDP1	Q96KN2	507 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	OR4K3	Q96R72	315 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	RUBCNL	Q9H714	662 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ZFAT	Q9P243	1243 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987		E7ESA3	106 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987		H0YIG0	161 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SGK494	L7N484	410 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CBX6	O95503	412 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	AP1S2	P56377	157 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MFAP5	Q13361	173 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF460	Q14592	562 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PCOLCE	Q15113	449 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TMEM205	Q6UW68	189 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SBSN	Q6UWP8	590 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PSMF1	Q92530	271 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	FBXL8	Q96CD0	374 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	HAUS8	Q9BT25	410 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	FBN3	Q75N90	2809 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	OR2W5	A6NFC9	320 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CDC7	O00311	574 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PIAS1	O75925	651 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SERPINA7	P05543	415 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	GRK3	P35626	688 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	SOX11	P35716	441 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CCR8	P51685	355 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	TAS2R39	P59534	338 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NUBP2-208	ENST00000565987	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		14.91	□□□□□ -0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms