RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 PERM1Q5SV97 790 aa22.86■■□□□ 1.25
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MEIS3-204ENST00000558555 TRPV3Q8NET8 790 aa22.86■■□□□ 1.25
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MEIS3-204ENST00000558555 AHSPQ9NZD4 102 aa22.82■■□□□ 1.24
MEIS3-204ENST00000558555 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
MEIS3-204ENST00000558555 NDUFS4O43181 175 aa22.82■■□□□ 1.24
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MEIS3-204ENST00000558555 RAP1GDS1P52306 607 aa22.82■■□□□ 1.24
MEIS3-204ENST00000558555 CCL7P80098 99 aa22.82■■□□□ 1.24
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