RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555114.5

NEDD1-207, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 3

Gene NEDD1, Length 731 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-207ENST00000555114 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 OR1F2PQ96R84 312 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.6□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 GABRR3A8MPY1 467 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 SGK494L7N484 410 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 TSPAN12O95859 305 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 STATHP02808 62 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 CCND1P24385 295 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 TBPL1P62380 186 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 SFT2D3Q587I9 215 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 SPINK14Q6IE38 97 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 C17orf64Q86WR6 236 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 CEP97Q8IW35 865 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 CALML6Q8TD86 181 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 CCDC138Q96M89 665 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 DHRS7Q9Y394 339 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD1-207ENST00000555114 OTOGQ6ZRI0 2925 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 PRRG2O14669 202 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 RDH16O75452 317 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 FGGP02679 453 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 JAK1P23458 1154 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 RGS4P49798 205 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 OR4D2P58180 307 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 HERC3Q15034 1050 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 C14orf79Q96F83 325 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 FRMD6Q96NE9 622 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 GPR21Q99679 349 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SLC30A3Q99726 388 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 LRFN1Q9P244 771 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 NDC80O14777 642 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 ASNA1O43681 348 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 AVILO75366 819 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 C8GP07360 202 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SP1P08047 785 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 MLNP12872 115 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 ZNF24P17028 368 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 KCNJ1P48048 391 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 TERF1P54274 439 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 CSNK1G2P78368 415 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 CTBP1Q13363 440 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 CD200R1Q8TD46 325 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 PEX11GQ96HA9 241 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 HES7Q9BYE0 225 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SCN2AQ99250 2005 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 F8P00451 2351 aa14.56□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 FEZF1A0PJY2 475 aa14.56□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 E9PLN8 166 aa14.56□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 FANCGO15287 622 aa14.56□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SLC25A12O75746 678 aa14.56□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 HIST1H2ADP20671 130 aa14.56□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SLC1A2P43004 574 aa14.56□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 MAGEA6P43360 314 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.9 ms