RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	OR2T29	Q8NH02	315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ELMO1	Q92556	727 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	BBS2	Q9BXC9	721 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ING2	Q9H160	280 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	C1orf226	A1L170	272 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275		E7EQ34	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	QSOX1	O00391	747 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	TSPAN6	O43657	245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	LILRB5	O75023	590 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	MTX2	O75431	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	JRK	O75564	520 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	LEFTY1	O75610	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	MYO1D	O94832	1006 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	INMT	O95050	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	PAPLN	O95428	1278 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ETHE1	O95571	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	CTSL	P07711	333 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	GSTM1	P09488	218 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	COX7A2	P14406	83 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	NPPB	P16860	134 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	CCNA2	P20248	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	FPR1	P21462	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	PDHA2	P29803	388 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	HOXA9	P31269	272 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	PCGF2	P35227	344 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ETV3	P41162	512 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ASMT	P46597	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	BMX	P51813	675 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	CRYBA2	P53672	197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	MLLT10	P55197	1068 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	GSTM4	Q03013	218 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	BNIP3	Q12983	259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	KEAP1	Q14145	624 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	ACOX1	Q15067	660 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IFT122-231	ENST00000514275	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms