RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TSPAN6	O43657	245 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GMFG	O60234	142 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TFAP2A	P05549	437 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FGF4	P08620	206 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ALPPL2	P10696	532 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ETV3	P41162	512 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RHAG	Q02094	409 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CD47	Q08722	323 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ST3GAL4	Q11206	333 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MAVS	Q7Z434	540 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GHDC	Q8N2G8	530 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CPA6	Q8N4T0	437 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SNX33	Q8WV41	574 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NUP205	Q92621	2012 aa		7.8	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2QL1	A1L167	161 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MATN4	O95460	622 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FGF19	O95750	216 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RLN1	P04808	185 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PTN	P21246	168 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CPN2	P22792	545 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MYF6	P23409	242 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CCR8	P51685	355 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RAB8A	P61006	207 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC32	Q14392	662 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL22	Q53GT1	634 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	APCDD1	Q8J025	514 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FNDC8	Q8TC99	324 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	UFD1	Q92890	307 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IGSF21	Q96ID5	467 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	UCK2	Q9BZX2	261 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TREX1	Q9NSU2	369 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IL36A	Q9UHA7	158 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OARD1	Q9Y530	152 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PQY0	241 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SOCS5	O75159	536 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GJB3	O75712	270 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	APOL3	O95236	402 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MAGEA3	P43357	314 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OMP	P47874	163 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NFATC3	Q12968	1075 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	E2F2	Q14209	437 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IDNK	Q5T6J7	187 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LGALS12	Q96DT0	336 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	VAPA	Q9P0L0	249 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LEFTY2	O00292	366 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	C7	P10643	843 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	F5	P12259	2224 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	BPI	P17213	487 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ACRV1	P26436	265 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ABAT	P80404	500 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	DOC2A	Q14183	400 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf27A	Q580R0	203 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LSMEM2	Q8N112	164 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LILRA2	Q8N149	483 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MEIOB	Q8N635	442 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GPR151	Q8TDV0	419 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IFT27	Q9BW83	186 aa		7.79	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16

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