RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RHOJQ9H4E5 214 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DYTNA2CJ06 578 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR1F1O43749 312 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WFS1O76024 890 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLHL18O94889 574 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STATHP02808 62 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL1RNP18510 177 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XCR1P46094 333 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HNMTP50135 292 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PGGT1BP53609 377 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAS2R39P59534 338 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDKL1Q00532 357 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC16Q13042 620 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYS1Q717R9 158 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCT2Q8NC54 265 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRR7Q8TB68 274 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMF1Q92530 271 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDKL2Q92772 493 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COL12A1Q99715 3063 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ESPL1Q14674 2120 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BLACEA4D250 179 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SGK494L7N484 410 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FANCGO15287 622 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CASQ1P31415 396 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SOX11P35716 441 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AHRP35869 848 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AGTR2P50052 363 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC12A2P55011 1212 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARG2P78540 354 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POU4F1Q01851 419 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCOLCEQ15113 449 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NR6A1Q15406 480 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HAS2Q92819 552 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEIL2Q969S2 332 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNDP1Q96KN2 507 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR1F2PQ96R84 312 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PELI2Q9HAT8 420 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OARD1Q9Y530 152 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 URADA6NGE7 173 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC7O00311 574 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDUFS4O43181 175 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 JRKO75564 520 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDAH2O95865 285 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UQCRHP07919 91 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GSTA2P09210 222 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYBL2P10244 700 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCTRP47872 440 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAV1Q03135 178 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RGS1Q08116 209 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRPV3Q8NET8 790 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NT5CQ8TCD5 201 aa14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms