RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 GPIP06744 558 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TIMP2P16035 220 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 JAK1P23458 1154 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CLCNKAP51800 687 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PHC1P78364 1004 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CHIT1Q13231 466 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 LAPTM5Q13571 262 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ACOX1Q15067 660 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PLCL1Q15111 1095 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NDUFA5Q16718 116 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SYT12Q8IV01 421 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SPERTQ8NA61 448 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ASB11Q8WXH4 323 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HPS1Q92902 700 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 THAP11Q96EK4 314 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 APIPQ96GX9 242 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF583Q96ND8 569 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ADI1Q9BV57 179 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GIN1Q9NXP7 522 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMEM131Q92545 1883 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CFAP99D6REC4 459 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SNAP29O95721 258 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HTR1EP28566 365 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IFNA8P32881 189 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TUBA4AP68366 448 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IRF8Q02556 426 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CYP4F3Q08477 520 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NAE1Q13564 534 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SYTL3Q4VX76 610 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CARM1Q86X55 608 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 C10orf111Q8N326 155 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DPP10Q8N608 796 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMEM159Q96B96 161 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CDC6Q99741 560 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 INPP5KQ9BT40 448 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IGFLR1Q9H665 355 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RDH14Q9HBH5 336 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OLAHQ9NV23 265 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PCM1Q15154 2024 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PR77 199 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 AREL1O15033 823 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CLOCKO15516 846 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 H6PDO95479 791 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ANXA6P08133 673 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ELFN1P0C7U0 828 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CYP2A7P20853 494 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 VIPR1P32241 457 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 S100A3P33764 101 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 BDKRB1P46663 353 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 C21orf59P57076 290 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CD300CQ08708 224 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MERTKQ12866 999 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 KIAA0040Q15053 153 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF284Q2VY69 593 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 UTS2BQ765I0 119 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 STK32CQ86UX6 486 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 C12orf40Q86WS4 652 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMIEQ8NEW7 156 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TFAP2CQ92754 450 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 AP2M1Q96CW1 435 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SIAEQ9HAT2 523 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms