RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 AP1S2P56377 157 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PHEXP78562 749 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TFF2Q03403 129 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CYP4F3Q08477 520 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 DMPKQ09013 629 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 RPA4Q13156 261 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SGCGQ13326 291 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF846Q147U1 533 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MAPKAPK3Q16644 382 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZS52 159 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CACUL1Q86Y37 369 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 FAM110BQ8TC76 370 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MUL1Q969V5 352 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 FAM162AQ96A26 154 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ESAMQ96AP7 390 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 FBXL8Q96CD0 374 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TEX37Q96LM6 180 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MUS81Q96NY9 551 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 NELL2Q99435 816 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 NTMT1Q9BV86 223 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 DPY30Q9C005 99 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ACTR8Q9H981 624 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SGK2Q9HBY8 427 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 HMG20AQ9NP66 347 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 K7EPI3 171 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 UPK1AO00322 258 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CXCR6O00574 342 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ANKRD28O15084 1053 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SLC22A1O15245 554 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 KCNJ13O60928 360 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 STK16O75716 305 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 FKBP9O95302 570 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CST1P01037 141 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PCCBP05166 539 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ANXA5P08758 320 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 EBLN1P0CF75 366 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 G6PDP11413 515 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 EPORP19235 508 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 IL12AP29459 219 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ACSL1P33121 698 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 RYKP34925 604 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 GNPDA1P46926 289 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PREPP48147 710 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MTPNP58546 118 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PPP2CBP62714 309 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PPP2CAP67775 309 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PPP2R2BQ00005 443 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MVKQ03426 396 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TRAF3Q13114 568 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 IMPG1Q17R60 797 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 FGD3Q5JSP0 725 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 METRNLQ641Q3 311 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZSR9 355 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MICU2Q8IYU8 434 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SVOPQ8N4V2 548 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms