RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CAPS2Q9BXY5 557 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ING2Q9H160 280 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A18Q9H1K4 315 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 VPS11Q9H270 941 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC11Q9NVH1 559 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 GPRC5BQ9NZH0 403 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ZFP69BQ9UJL9 534 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ASB1Q9Y576 335 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 PCSK5Q92824 1860 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 CCDC189A1A4V9 331 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 COL6A6A6NMZ7 2263 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TRIM49D1C9J1S8 452 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF4O60810 478 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 RFPL1O75677 317 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 S100BP04271 92 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CNTFP26441 200 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF8P28908 595 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 OCA2Q04671 838 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PWP1Q13610 501 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SLC29A2Q14542 456 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 VWA2Q5GFL6 755 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ATG9BQ674R7 924 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TAOK1Q7L7X3 1001 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PRSS41Q7RTY9 318 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D19Q8N5T2 526 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 OR9A4Q8NGU2 314 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 IP6K3Q96PC2 410 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CD244Q9BZW8 370 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ZNF358Q9NW07 568 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SUPT3HB4E1H0 165 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MAP2K7O14733 419 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 FFAR3O14843 346 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 GPR42O15529 346 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.772e-11■■■□□ 17.4
ACTB-211ENST00000480301 SUPT3HO75486 399 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 NSA2O95478 260 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ZGLP1P0C6A0 271 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SLC35G6P0C7Q6 338 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 IL1RNP18510 177 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MMP11P24347 488 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 AHRP35869 848 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 AVPR1BP47901 424 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 AGTR2P50052 363 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SYT16Q17RD7 645 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ADGRD1Q6QNK2 874 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MED25Q71SY5 747 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 NT5CQ8TCD5 201 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 UBTD2Q8WUN7 234 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 NACC2Q96BF6 587 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MIEF2Q96C03 454 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ACSS2Q9NR19 701 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TRPC4Q9UBN4 977 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A7Q9Y694 548 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MED13Q9UHV7 2174 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SYCE1LA8MT33 242 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 H0YIG0 161 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 NDUFS4O43181 175 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 EPORP19235 508 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CCL11P51671 97 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 KLC1Q07866 573 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PDK4Q16654 411 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 LAPTM4BQ86VI4 370 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PDSS2Q86YH6 399 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SHISA5Q8N114 240 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SNX31Q8N9S9 440 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 YIPF2Q9BWQ6 316 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TGIF2Q9GZN2 237 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 EHD1Q9H4M9 534 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SEMA3GQ9NS98 782 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 P4HTMQ9NXG6 502 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 COPG2Q9UBF2 871 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ESPNB1AK53 854 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MKRN2OSH3BPM6 223 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 K7EM74 188 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SOCS6O14544 535 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CLGNO14967 610 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 KLK8O60259 260 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SERPIND1P05546 499 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CXCR2P25025 360 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 C19orf57Q0VDD7 668 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 HYAL2Q12891 473 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
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