RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 BLMHQ13867 455 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SEMA3AQ14563 771 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NR1D2Q14995 579 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TLR1Q15399 786 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CHRNA6Q15825 494 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GPR33Q49SQ1 333 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PIGGQ5H8A4 983 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MANEAQ5SRI9 462 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 KANK2Q63ZY3 851 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TTC23LQ6PF05 361 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 IYDQ6PHW0 289 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SNX20Q7Z614 316 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SFRP1Q8N474 314 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TTC9Q92623 222 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 EXTL1Q92935 676 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GLYATL1Q969I3 302 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PTERQ96BW5 349 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ROPN1LQ96C74 230 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 RCN3Q96D15 328 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GPR21Q99679 349 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 WDR41Q9HAD4 459 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 APMAPQ9HDC9 416 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 IL17CQ9P0M4 197 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PCM1Q15154 2024 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 COL12A1Q99715 3063 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 A6NCN8 305 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UBXN8O00124 270 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CCL22O00626 93 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 DUX1O43812 170 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NRP2O60462 931 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CDK14O94921 469 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MATN4O95460 622 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 BAG2O95816 211 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UROSP10746 265 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 LIPCP11150 499 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 F3P13726 295 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MTHFD2P13995 350 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 IDO1P14902 403 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CHRM3P20309 590 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CCR10P46092 362 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SEPHS1P49903 392 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 RHDQ02161 417 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 FOXM1Q08050 763 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PEX6Q13608 980 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 FLOT2Q14254 428 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 OR4D1Q15615 310 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PFKFB4Q16877 469 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 OGFOD2Q6N063 350 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 DET1Q7L5Y6 550 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GPSM1Q86YR5 675 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 HPS6Q86YV9 775 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.03□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MIER2Q8N344 545 aa6.03□□□□□ -1.44
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