RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 OR2T5Q6IEZ7 315 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF547Q8IVP9 402 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 RNF175Q8N4F7 328 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 OXR1Q8N573 874 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ARL10Q8N8L6 244 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 OR2T29Q8NH02 315 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 MAGED4Q96JG8 741 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 REEP4Q9H6H4 257 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CERS4Q9HA82 394 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TPT1P8Q9HAU6 139 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ATAD3AQ9NVI7 634 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 BLOC1S6Q9UL45 172 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 VPS4AQ9UN37 437 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 YY2O15391 372 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 GSTM2P28161 218 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PCSK6P29122 969 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 HSD17B2P37059 387 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ITGA1P56199 1179 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TAP2Q03519 686 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF234Q14588 700 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TEAD4Q15561 434 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 RAET1GQ6H3X3 334 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 C11orf96Q7Z7L8 435 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CFAP206Q8IYR0 622 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 OR2AG1Q9H205 316 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 OR52A5Q9H2C5 316 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ORC6Q9Y5N6 252 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PIPSLA2A3N6 862 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 M0QX08 132 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PI15O43692 258 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PCDH7O60245 1069 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 UGT2B11O75310 529 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 B3GALT4O96024 378 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 FABP3P05413 133 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 FPR1P21462 350 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SERPINB1P30740 379 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SLC6A11P48066 632 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 RPS13P62277 151 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 KCNAB2Q13303 367 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 RAB39AQ14964 217 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SPESP1Q6UW49 350 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PDZD3Q86UT5 571 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 METTL4Q8N3J2 472 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SMURF2Q9HAU4 748 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 GDE1Q9NZC3 331 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 GPR89AB7ZAQ6 455 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TBX19O60806 448 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SEC14L2O76054 403 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CCDC159P0C7I6 412 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 GPR89BP0CG08 455 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 RPL10P27635 214 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 METAP1P53582 386 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ISL1P61371 349 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 RBBP4Q09028 425 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PMS2P3Q13401 168 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF621Q6ZSS3 439 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM26Q6ZUK4 368 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TMPRSS11BQ86T26 416 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF366Q8N895 744 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ING2Q9H160 280 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PADI2Q9Y2J8 665 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 KELP23276 732 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 VIPR2P41587 438 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 GSTM5P46439 218 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms