RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 STARD3Q14849 445 aa26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 OR13F1Q8NGS4 319 aa26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 OR2L2Q8NH16 312 aa26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 ZFP90Q8TF47 636 aa26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 SAMD11Q96NU1 681 aa26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 TMEM106CQ9BVX2 250 aa26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 TMEM245Q9H330 911 aa26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 DMRT3Q9NQL9 472 aa26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 FZD4Q9ULV1 537 aa26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 VPS4AQ9UN37 437 aa26.61■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 A0A1B0GVG6 124 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 PIPSLA2A3N6 862 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 H3BMQ9 156 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 IGFBP5P24593 272 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 ACADLP28330 430 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 RYKP34925 604 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 ISL1P61371 349 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 CD47Q08722 323 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 ZNF234Q14588 700 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 FAM78AQ5JUQ0 283 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 COG8Q96MW5 612 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa26.6■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 GPR107Q5VW38 600 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 PIK3C3Q8NEB9 887 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 SLC5A11Q8WWX8 675 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 NRBF2Q96F24 287 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 HSH2DQ96JZ2 352 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 DYRK4Q9NR20 520 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 BAG5Q9UL15 447 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 TRIM64BA6NI03 449 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 PLK4O00444 970 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 POP7O75817 140 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 GSTM2P28161 218 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 RPS6KA3P51812 740 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 VLDLRP98155 873 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 GAB1Q13480 694 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 TUBA3CQ13748 450 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 C16orf72Q14CZ0 275 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 RGNQ15493 299 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 MEP1AQ16819 746 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 XAF1Q6GPH4 301 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 UNC5DQ6UXZ4 953 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 COMMD6Q7Z4G1 85 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 VTCN1Q7Z7D3 282 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 FBLIM1Q8WUP2 373 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 ASB16Q96NS5 453 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 REEP4Q9H6H4 257 aa26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 HEPACAM2A8MVW5 462 aa26.58■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 FPR1P21462 350 aa26.58■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 ARMCX6Q7L4S7 300 aa26.58■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 GALNT10Q86SR1 603 aa26.58■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 GAB3Q8WWW8 586 aa26.58■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 FANCEQ9HB96 536 aa26.58■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 SH3BP4Q9P0V3 963 aa26.58■■□□□ 1.85
CERS1-201ENST00000429504 BCKDKO14874 412 aa26.58■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 DPM1O60762 260 aa26.58■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 SEC14L2O76054 403 aa26.58■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 NXPE4Q6UWF7 544 aa26.58■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 CEP68Q76N32 757 aa26.58■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 CYP4Z1Q86W10 505 aa26.58■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 SMARCD2Q92925 531 aa26.58■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 ATAD3AQ9NVI7 634 aa26.58■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa26.58■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 PCGF2P35227 344 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 NFE2L1Q14494 772 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 KDM4DQ6B0I6 523 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 CRTC3Q6UUV7 619 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 C11orf96Q7Z7L8 435 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 HORMAD1Q86X24 394 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 OR4A15Q8NGL6 344 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 MAGED4Q96JG8 741 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 NUMA1Q14980 2115 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 COL4A3Q01955 1670 aa26.57■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 hCG_2039718K7EN88 272 aa26.56■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 UGT2B11O75310 529 aa26.56■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 ATE1O95260 518 aa26.56■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 FKBP9O95302 570 aa26.56■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 RPL3P39023 403 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CERS1-201ENST00000429504 PIK3CBP42338 1070 aa26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms