RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 DTX3Q8N9I9 347 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CCL16O15467 120 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NKX3-2P78367 333 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SYTL3Q4VX76 610 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 AGAP6Q5VW22 663 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 Q6ZVL8 140 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 HORMAD1Q86X24 394 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 AGAP4Q96P64 663 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TIGARQ9NQ88 270 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GBAP04062 536 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 HTR2BP41595 481 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 KIR3DL1P43629 444 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NAE1Q13564 534 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GBX1Q14549 363 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GPR33Q49SQ1 333 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MPPE1Q53F39 396 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TPGS2Q68CL5 300 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GAREM2Q75VX8 874 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 YME1L1Q96TA2 773 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SMLR1H3BR10 107 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CREMQ03060 361 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 FPGTO14772 594 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ABLIM3O94929 683 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SRCP12931 536 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CBLP22681 906 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 IRF3Q14653 427 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ERAP2Q6P179 960 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM25Q86YD3 366 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 NATD1Q8N6N6 113 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SCELO95171 688 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC159P0C7I6 412 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CYP2A7P20853 494 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 LHCGRP22888 699 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PREPP48147 710 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SLC35A2P78381 396 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PTSQ03393 145 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SPATS1Q496A3 300 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 AADATQ8N5Z0 425 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 KCNC2Q96PR1 638 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SP140LQ9H930 580 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 USE1Q9NZ43 259 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PATJQ8NI35 1801 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 M0QX08 132 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DSCR3O14972 297 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TLL1O43897 1013 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 HLA-FP30511 346 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DAPP51397 102 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 UBE3AQ05086 875 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 OMA1Q96E52 524 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ALG14Q96F25 216 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 RNF6Q9Y252 685 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 A0A0C4DFX4 3053 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MYO9BQ13459 2157 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms