RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 DLX3O60479 287 aa3.29□□□□□ -1.88
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SNORD17-201ENST00000390930 SUPT3HO75486 399 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 JRKO75564 520 aa3.29□□□□□ -1.88
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SNORD17-201ENST00000390930 KLHL18O94889 574 aa3.29□□□□□ -1.88
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SNORD17-201ENST00000390930 CDC16Q13042 620 aa3.29□□□□□ -1.88
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SNORD17-201ENST00000390930 DSG2Q14126 1118 aa3.29□□□□□ -1.88
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SNORD17-201ENST00000390930 PDK4Q16654 411 aa3.29□□□□□ -1.88
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SNORD17-201ENST00000390930 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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SNORD17-201ENST00000390930 CABS1Q96KC9 395 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
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