RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPATA5Q8NB90 893 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR5M9Q8NGP3 310 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR1B1Q8NGR6 318 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NFKBIDQ8NI38 313 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ETNPPLQ8TBG4 499 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC26A7Q8TE54 656 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRK7Q8WTQ7 553 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 IRGQQ8WZA9 623 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCT6BQ92526 530 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMARCD2Q92925 531 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SGCZQ96LD1 299 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 COG8Q96MW5 612 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM218AQ96MZ4 157 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SFXN2Q96NB2 322 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NEK1Q96PY6 1258 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TAAR6Q96RI8 345 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDOQ99489 341 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAD9AQ99638 391 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIR2DL4Q99706 377 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 REEP2Q9BRK0 252 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 HGH1Q9BTY7 390 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NACAP1Q9BZK3 213 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 COG4Q9H9E3 785 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLCB1Q9NQ66 1216 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 HPS4Q9NQG7 708 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABCC13Q9NSE7 274 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 DEPPQ9NTK1 212 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TAS2R10Q9NYW0 307 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLIC5Q9NZA1 410 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SARDHQ9UL12 918 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSG11Q9UQ72 335 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 ERVW-1Q9UQF0 538 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 TEX264Q9Y6I9 313 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SESN1Q9Y6P5 492 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 R4GN57 208 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLIT3O75094 1523 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-187P-201ENST00000384139 IL16Q14005 1332 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAV40A0A0B4J280 105 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1B0GW55 424 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZFP92A6NM28 416 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCT8L1PA6NM43 557 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF878C9JN71 531 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 F5H423 210 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 I3L1I5 382 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 J3QKU1 62 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNF103O00237 685 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 IMPA2O14732 288 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPS6KA5O75582 802 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TOXO94900 526 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLU7O95391 586 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 RETP07949 1114 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUX4L2P0CJ85 424 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUX4L3P0CJ86 424 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUX4L5P0CJ88 424 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUX4L6P0CJ89 424 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUX4L7P0CJ90 424 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 EEF2P13639 858 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 P4HA1P13674 534 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 DARSP14868 501 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CD1DP15813 335 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADRA2CP18825 462 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CD22P20273 847 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CTNNA2P26232 953 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SFTPDP35247 375 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 BSGP35613 385 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 NUDT1P36639 197 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 GP5P40197 560 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 MDH2P40926 338 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 POU3F4P49335 361 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDST1P52848 882 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 IST1P53990 364 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 UBXN2AP68543 259 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SIRPAP78324 504 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TLE2Q04725 743 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRPC3Q13507 836 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TDGQ13569 410 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 MELKQ14680 651 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 HERC3Q15034 1050 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 IRF4Q15306 451 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TGIF1Q15583 401 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms