RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXO27Q8NI29 283 aa26.56■■□□□ 1.84
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TRAPPC10-202ENST00000380221 ZUFSPQ96AP4 578 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC3Q9BQI4 270 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZMYND15Q9H091 742 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEMA6CQ9H3T2 930 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM9BQ9NQ34 198 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASXL3Q9C0F0 2248 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 FLRT2O43155 660 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 RGS14O43566 566 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 SH3BGRLO75368 114 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT16P08779 473 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 THRAP10827 490 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ST6GAL1P15907 406 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCL6P41182 706 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP4BP51164 291 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS13P62277 151 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP4F2P78329 520 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZIC1Q15915 447 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 INAVAQ3KP66 663 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFI44Q8TCB0 444 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 FCRL4Q96PJ5 515 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHBGQ9H310 441 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYNPO2LQ9H987 977 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPHA6Q9UF33 1036 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL3Q9UH77 587 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLK4Q9Y5K2 254 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPEGQ15772 3267 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERTM1A2A2V5 107 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 LSM1O15116 133 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD59P13987 128 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 MXRA7P84157 204 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF33BQ06732 778 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 NR6A1Q15406 480 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 OGFOD2Q6N063 350 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZDHHC12Q96GR4 267 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKDD1BA6NHY2 528 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTSVO60911 334 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRP3O75074 770 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ETHE1O95571 254 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 TGM1P22735 817 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSF2RBP32927 897 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP4F3Q08477 520 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC14A1Q13336 389 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXO42Q6P3S6 717 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNX32Q86XE0 403 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
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TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNH6Q9H252 994 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 BRF2Q9HAW0 419 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 DMRT3Q9NQL9 472 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1GALT1Q9NS00 363 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM9Q9P0T7 183 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKMY1Q9P2S6 941 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 TGFB1P01137 390 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIK3CBP42338 1070 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 STX1BP61266 288 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 HERC3Q15034 1050 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA19Q7Z5L4 167 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf21Q9H246 121 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 EZRP15311 586 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 AP5B1Q2VPB7 878 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 C6orf136Q5SQH8 315 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLXDC1Q8IUK5 500 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBC1D19Q8N5T2 526 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUDT22Q9BRQ3 303 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSC2O15499 205 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 SH3BP5O60239 455 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 STATHP02808 62 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSD3B1P14060 373 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSD3B2P26439 372 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHEXP78562 749 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCL7P80098 99 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 VPS29Q9UBQ0 182 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADGRE2Q9UHX3 823 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 PILRAQ9UKJ1 303 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
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