RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SHC2P98077 582 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ART3Q13508 389 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PDK4Q16654 411 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NIPAL1Q6NVV3 410 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HSDL2Q6YN16 418 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SPRED1Q7Z699 444 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CMC1Q7Z7K0 106 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A9Q8IVM8 553 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR4N5Q8IXE1 308 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FNDC5Q8NAU1 212 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR9A4Q8NGU2 314 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GPBAR1Q8TDU6 330 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ERP27Q96DN0 273 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NRSN2Q9GZP1 204 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 P4HTMQ9NXG6 502 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF232Q9UNY5 417 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NFS1Q9Y697 457 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 WWP2O00308 870 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ABCB7O75027 752 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 UGT2B7P16662 529 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CLCN2P51788 898 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R39P59534 338 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 STX3Q13277 289 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA3AQ14563 771 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HERC3Q15034 1050 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GPAT3Q53EU6 434 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MANEALQ5VSG8 457 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF621Q6ZSS3 439 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP14Q86W24 1093 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RGMAQ96B86 450 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZIM3Q96PE6 472 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RHOJQ9H4E5 214 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NOX1Q9Y5S8 564 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TSC2P49815 1807 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 H0YGG7 62 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6AP2O75787 350 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP9O95302 570 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CPA3P15088 417 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ST6GAL1P15907 406 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IVDP26440 423 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ARSDP51689 593 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NAGLUP54802 743 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NUP107P57740 925 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GPR85P60893 370 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RAET1LQ5VY80 246 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 BHLHB9Q6PI77 547 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SPESP1Q6UW49 350 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ENPP6Q6UWR7 440 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 UNC5DQ6UXZ4 953 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GK5Q6ZS86 529 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MIER2Q8N344 545 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
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