RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343217.6

DUSP28-201, Transcript of dual specificity phosphatase 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene DUSP28, Length 1,555 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28-201ENST00000343217 HMGCS1Q01581 520 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 C1orf61Q13536 156 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 PLCL1Q15111 1095 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 NAGSQ8N159 534 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 OR2A1Q8NGT9 310 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CMTM7Q96FZ5 175 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 BTBD10Q9BSF8 475 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 C1orf21Q9H246 121 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 SRMSQ9H3Y6 488 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 NMRK1Q9NWW6 199 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 DOLKQ9UPQ8 538 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ANKRD65E5RJM6 399 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 SEC22BO75396 215 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ACPPP15309 386 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 GPX3P22352 226 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 PIK3CBP42338 1070 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 DIO3P55073 304 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CYP4F3Q08477 520 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 HES3Q5TGS1 186 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 FAM9CQ8IZT9 166 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 OR4E2Q8NGC2 313 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 OR4K1Q8NGD4 311 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 SLC37A2Q8TED4 501 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 NT5DC2Q9H857 520 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ZIM2Q9NZV7 527 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 VPS29Q9UBQ0 182 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 PPT2Q9UMR5 302 aa20■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 LOC100653049A0A140TA62 436 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 B2RBV5 119 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 KRT34O76011 436 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 PCNAP12004 261 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 MAPK1P28482 360 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 SERPINB1P30740 379 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 STX5Q13190 355 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 KIR2DS3Q14952 304 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 AGKQ53H12 422 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CACHD1Q5VU97 1274 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 SNX32Q86XE0 403 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 POU5F2Q8N7G0 328 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 HUS1BQ8NHY5 278 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 LMX1AQ8TE12 382 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 NRTNQ99748 197 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 C1orf50Q9BV19 199 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 SLC25A23Q9BV35 468 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 NLGN3Q9NZ94 848 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC167Q9P0B6 97 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 RAXQ9Y2V3 346 aa19.99■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ITPR1Q14643 2758 aa19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 GYG2O15488 501 aa19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 AQP9O43315 295 aa19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 PSMB5P28074 263 aa19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CMPK1P30085 196 aa19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 GPR18Q14330 331 aa19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 IL23RQ5VWK5 629 aa19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 TSPEARQ8WU66 669 aa19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 TWSG1Q9GZX9 223 aa19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 TAS2R1Q9NYW7 299 aa19.98■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CACNA1GO43497 2377 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 LMO7DNF2Z398 122 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ALPPL2P10696 532 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CKMT1AP12532 417 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CPA2P48052 419 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 MXRA7P84157 204 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 REEP5Q00765 189 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 HHEXQ03014 270 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 KIAA0040Q15053 153 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 SF1Q15637 639 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 DNAL1Q4LDG9 190 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 PAOXQ6QHF9 649 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 FAM181AQ8N9Y4 354 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 OR2L3Q8NG85 312 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 PATE1Q8WXA2 126 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 TMEM184CQ9NVA4 438 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 LHX6Q9UPM6 363 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa19.97■□□□□ 0.79
DUSP28-201ENST00000343217 ASXL3Q9C0F0 2248 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms