RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NLGN4XQ8N0W4 816 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MECRQ9BV79 373 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CUTCQ9NTM9 273 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 RNF11Q9Y3C5 154 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ACACBO00763 2458 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PPP6CO00743 305 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TM9SF1O15321 606 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 RAD1O60671 282 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN9O95484 217 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ALDH3A1P30838 453 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 HNF4AP41235 474 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJB13P59910 316 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 GPS2Q13227 327 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 E2F2Q14209 437 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TGIF1Q15583 401 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf189Q5VU69 101 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 GRHL2Q6ISB3 625 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MED27Q6P2C8 311 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CCT6BQ92526 530 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TM4SF19Q96DZ7 209 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NTMT1Q9BV86 223 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NT5DC2Q9H857 520 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ENAMQ9NRM1 1142 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ANKDD1BA6NHY2 528 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 UGDHO60701 494 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ZWINTO95229 277 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 OTCP00480 354 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CCNYL3P0C7X3 344 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ETV4P43268 484 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TRAF3Q13114 568 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MUM1Q2TAK8 710 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MILR1Q7Z6M3 343 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 DTX1Q86Y01 620 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ESX1Q8N693 406 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 IL22RA1Q8N6P7 574 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TRPV3Q8NET8 790 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TTLQ8NG68 377 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 UBE2E3Q969T4 207 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SH3GL2Q99962 352 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.29■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MEN1O00255 615 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM13O60858 407 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PCNAP12004 261 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 RORAP35398 523 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 GCGRP47871 477 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 RGS1Q08116 209 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ASPHQ12797 758 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MPP2Q14168 576 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ADNP2Q6IQ32 1131 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 DSELQ8IZU8 1212 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD42Q8N9B4 389 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 L3MBTL4Q8NA19 623 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 KCT2Q8NC54 265 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 OR4F6Q8NGB9 312 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 KCNE4Q8WWG9 221 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MR1Q95460 341 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NKD1Q969G9 470 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 C10orf90Q96M02 699 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 LRFN5Q96NI6 719 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 DRC3Q9H069 523 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 GSTO2Q9H4Y5 243 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PADI1Q9ULC6 663 aa21.28■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GTL3 188 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GX78 115 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM120BA0PK00 339 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 DSCR3O14972 297 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MED26O95402 600 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MLYCDO95822 493 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ATP1A2P50993 1020 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 LCP2Q13094 533 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PWP1Q13610 501 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MAP7Q14244 749 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NDUFA9Q16795 377 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TTMPQ5BVD1 217 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 DTWD1Q8N5C7 304 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 OR7G3Q8NG95 312 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PROKR1Q8TCW9 393 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.27■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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