RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276654.9

LRP12-201, Transcript of LDL receptor related protein 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP12, Length 4,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12-201ENST00000276654 COMTP21964 271 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 MAGEA1P43355 309 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 TYRO3Q06418 890 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 DEFB134Q4QY38 66 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 FIGNQ5HY92 759 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 LINC00523Q86TU6 105 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 LINC01560Q8TB33 94 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 URADA6NGE7 173 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 HACD1B0YJ81 288 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 INAFM1C9JVW0 142 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 PROM1O43490 865 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CYP1A2P05177 515 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 SLC1A1P43005 524 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 TRPC1P48995 793 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 SSR4P51571 173 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 OLR1P78380 273 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.247e-10■■■□□ 15.7
LRP12-201ENST00000276654 SHEQ5VZ18 495 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 PIANPQ8IYJ0 282 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 MDFIQ99750 246 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 GBA3Q9H227 469 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 B4GALT7Q9UBV7 327 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 WISP2O76076 250 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 TACR1P25103 407 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CPOXP36551 454 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 STX4Q12846 297 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 FAM13CQ8NE31 585 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 KRT12Q99456 494 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 NFS1Q9Y697 457 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CCDC88CQ9P219 2028 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 WWP2O00308 870 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 MYO1DO94832 1006 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 TTPAP49638 278 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 PTK6Q13882 451 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 VEZF1Q14119 521 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 LUZP2Q86TE4 346 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 TSLPQ969D9 159 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 Q96MF0 132 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 FRMD6Q96NE9 622 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 RASSF1Q9NS23 344 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 BFARQ9NZS9 450 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 BCKDKO14874 412 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 OR1F1O43749 312 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 NRDCO43847 1150 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 TJP3O95049 919 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 WASHC5Q12768 1159 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 RCN2Q14257 317 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 COX15Q7KZN9 410 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 SULF2Q8IWU5 870 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 FATE1Q969F0 183 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 MED18Q9BUE0 208 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CTAG2O75638 210 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 ARSEP51690 589 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 SARGQ9BW04 601 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 CADP27708 2225 aa7.28□□□□□ -1.24
LRP12-201ENST00000276654 KRT87PA6NCN2 255 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms