RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GlrbP48168 496 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtskP55097 329 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CidecP56198 239 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10696Q3UTC4 357 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd28Q505D1 1053 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ggt1Q60928 568 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxj1Q61660 421 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BC061212Q6P8K3 481 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mfsd13aQ6PDE8 519 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olig3Q6PFG8 273 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf503Q7TMA2 652 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700001J03RikQ80ZR8 219 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfyve1Q810J8 777 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2-M10.2Q85ZW9 329 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cstf2Q8BIQ5 580 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clec9aQ8BRU4 238 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AntxrlQ8BVM2 641 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam131aQ8BWU3 361 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpat3Q8C0N2 438 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abi1Q8CBW3 481 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ahi1Q8K3E5 1047 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PolbQ8K409 335 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clstn3Q99JH7 956 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mlf2Q99KX1 247 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akirin1Q99LF1 191 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl54Q9CPW3 135 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gkn2Q9CQS6 184 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prl7c1Q9CRB5 251 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Efhc2Q9D485 750 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtf2e2Q9D902 292 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl46Q9EQI8 283 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc19a2Q9EQN9 498 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt81Q9ERE2 481 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Capn10Q9ESK3 666 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EefsecQ9JHW4 583 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GabrqQ9JLF1 638 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sgk2Q9QZS5 367 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc35a2Q9R0M8 390 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam25Q9R159 760 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa6.4□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tdrd6P61407 2134 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21885A0A286YDN8 145 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem236A2ARJ3 344 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rdh8D3Z6W3 317 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4450E9Q007 373 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm17615E9Q9P2 165 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf165E9QAU8 347 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r3H3BJ88 915 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smim18J3QNP2 93 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8897L7N294 181 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnk1O08581 336 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc32a1O35633 525 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Capns1O88456 269 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tp63O88898 680 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnn4O89109 425 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tuba1bP05213 451 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Surf2P09926 257 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TecP24604 630 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alox5P48999 674 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AcadvlP50544 656 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CntfP51642 198 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2c37P56654 490 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Copz1P61924 177 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tuba1aP68369 451 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gfi1P70338 423 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scgb1a1Q06318 96 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q3UK37 420 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P2rx5Q3UYI1 455 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RasefQ5RI75 627 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdh12Q5RJH3 794 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsd3b4Q61767 373 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BC080695Q66JY9 481 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx31Q6P8Y7 439 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il20raQ6PHB0 546 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Svs1Q6WIZ7 820 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fblim1Q71FD7 375 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vtcn1Q7TSP5 283 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Thnsl2Q80W22 483 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AardQ811W1 167 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BGK9 164 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BH50 245 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itih5Q8BJD1 952 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc142Q8CAI1 738 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8K039 155 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oas1gQ8K469 367 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HopxQ8R1H0 73 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Neto1Q8R4I7 533 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DhrsxQ8VBZ0 335 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1019Q8VGS3 310 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc2a10Q8VHD6 536 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif3mQ99JX4 374 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uqcc2Q9CQY6 136 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prps2Q9CS42 318 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bbs2Q9CWF6 721 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acbd7Q9D258 88 aa6.39□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9D454 513 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.1 ms