RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ift172Q6VH22 1749 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CckbrP56481 453 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trpc5osQ3UHV4 110 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rbm11Q80YT9 238 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tm9sf4Q8BH24 643 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stx16Q8BVI5 326 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pih1d2Q8CHR9 315 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam3cQ91VU0 227 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Snu13Q9D0T1 128 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem68Q9D850 329 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TrehQ9JLT2 576 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AtrnQ9WU60 1428 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pcgf2P23798 342 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc6a3Q61327 619 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ubxn7Q6P5G6 467 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rcor1Q8CFE3 480 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nectin4Q8R007 508 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Uts2rQ8VIH9 385 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rab25Q9WTL2 213 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp945E9PYM8 794 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttf1Q62187 859 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mblac2Q8BL86 279 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prokr2Q8K458 381 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chid1Q922Q9 393 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PollQ9QXE2 573 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 JamlQ80UL9 379 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Glt28d2Q8BML3 165 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ugt2b1Q8R084 529 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gdpd3Q99LY2 330 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmbim4Q9DA39 238 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1188A2AV10 312 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Esp18A8R0V1 91 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prrt4B2RU40 902 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr592E9PYB3 312 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 H2-EaP01904 255 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 P04224 255 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mks1Q5SW45 561 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc5a11Q8K0E3 673 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Apbb3Q8R1C9 486 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dusp15Q8R4V2 235 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tor1aQ9ER39 333 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PrelpQ9JK53 378 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp60P16374 707 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 B3gat2P59270 324 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fv1P70213 459 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr774Q7TRI5 312 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn1r188Q8K3N2 308 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PtprvP70289 1705 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lrrc15Q80X72 579 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pcdha2Q91Y17 948 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pdzd3Q99MJ6 498 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wdr53Q9DB94 358 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cib1Q9Z0F4 191 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bmpr1aP36895 532 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lasp1Q61792 263 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Npffr2Q924H0 417 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slco1a6Q99J94 670 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PglsQ9CQ60 257 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Coro7Q9D2V7 922 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem114Q9D563 222 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Yipf7Q9JIM5 254 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myh11O08638 1972 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nlgn4lB0F2B4 945 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 S100zB9EJL3 99 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm3336J3QMQ6 198 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm8857L7N291 182 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Oaz2O08608 189 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MylipQ8BM54 445 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GatcQ8CBY0 155 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tex19.2Q9D5S1 317 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kdelc1Q9JHP7 502 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 H2afb1S4R1E0 115 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 H2afb3S4R1G7 115 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HrQ61645 1182 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q9D979 236 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ndor1A2AI05 598 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp563B8JJZ9 448 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adamts8P57110 905 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr290Q7TS13 315 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Man2a2Q8BRK9 1152 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Igsf8Q8R366 611 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lrrc49Q91YK0 686 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r49D3Z6L3 852 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r32K7N686 852 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cyp17a1P27786 507 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Klhdc10Q6PAR0 439 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lix1lQ8BQ89 337 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nsmce2Q91VT1 247 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gjd3Q91YD1 278 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf32Q9JIT1 368 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddx60E9PZQ1 1711 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp992B1ASD8 573 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4930402K13RikB1AW18 415 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr891E9Q843 316 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AcadlP51174 430 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sidt2Q8CIF6 832 aa16.96■□□□□ 0.31
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Faim2Q8K097 317 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 61.6 ms