RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 BCHEP06276 602 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 C8BP07358 591 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ETS2P15036 469 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNA5P22460 613 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 VEGFBP49765 207 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CCNIQ14094 377 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ERMP1Q7Z2K6 904 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 OR8J3Q8NGG0 315 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MAPK15Q8TD08 544 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SCAMP4Q969E2 229 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TRIM8Q9BZR9 551 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNH6Q9H252 994 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TRIM39Q9HCM9 518 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SERTAD3Q9UJW9 196 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 OAZ3Q9UMX2 235 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CPED1A4D0V7 1026 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 C2orf74A8MZ97 194 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 OR1I1O60431 355 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ACVR2AP27037 513 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 AP3S2P59780 193 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 IL18R1Q13478 541 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TMBIM1Q969X1 311 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KXD1Q9BQD3 176 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 M0QX08 132 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PDCD5O14737 125 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TPST2O60704 377 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 JUNP05412 331 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 NR2C1P13056 603 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CXCR1P25024 350 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CASRP41180 1078 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 DECR1Q16698 335 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC25A24Q6NUK1 477 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PLET1Q6UQ28 207 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PAMR1Q6UXH9 720 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZFAND4Q86XD8 727 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 OR5AK3PQ8NH89 298 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM110BQ8TC76 370 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 LMX1AQ8TE12 382 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 DIRAS2Q96HU8 199 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MEIS3P2A8K0S8 358 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SOX30O94993 753 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 IVDP26440 423 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PPP3R1P63098 170 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 CREB5Q02930 508 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 GPR68Q15743 365 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM214AQ32MH5 1076 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 EMC10Q5UCC4 262 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MEAF6Q9HAF1 191 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SDHAF3Q9NRP4 125 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 C14orf105Q9NVL8 296 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 WASH4PA8MWX3 477 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 RUNX3Q13761 415 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 GANABQ14697 944 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ATG9BQ674R7 924 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 RANBP10Q6VN20 620 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 NPWQ8N729 165 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 OR10H4Q8NGA5 316 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNA7Q96RP8 456 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TRIM2Q9C040 744 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MCUBQ9NWR8 336 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ING3Q9NXR8 418 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 DAPL1A0PJW8 107 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SCDO00767 359 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SMSP52788 366 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 IL18Q14116 193 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ADNP2Q6IQ32 1131 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ANO7Q6IWH7 933 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 NOXRED1Q6NXP6 359 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KAT2AQ92830 837 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PDCD10Q9BUL8 212 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 OR51V1Q9H2C8 321 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 TM9SF3Q9HD45 589 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PTTG2Q9NZH5 202 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 HSFX1Q9UBD0 423 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 SDHDO14521 159 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 IFNA6P05013 189 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF3P17036 446 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 C5AR1P21730 350 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 UQCRC2P22695 453 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 AAK1Q2M2I8 961 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 REEP3Q6NUK4 255 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 BIRC7Q96CA5 298 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms