RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NPAS1Q99742 590 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MED10Q9BTT4 135 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 HAO1Q9UJM8 370 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 LINC00862A6NCI5 91 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 H3BMM5 538 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ABCD4O14678 606 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SPDEFO95238 335 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CRHP06850 196 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZNF23P17027 643 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 HPCAL1P37235 193 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 EPHA5P54756 1037 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CDH13P55290 713 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RAB33AQ14088 237 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SFT2D3Q587I9 215 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MSANTD2Q6P1R3 559 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CXCL17Q6UXB2 119 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GPAT4Q86UL3 456 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SCML4Q8N228 414 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 REPS1Q96D71 796 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SGTBQ96EQ0 304 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 KCNK16Q96T55 309 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ASB8Q9H765 288 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CEP350Q5VT06 3117 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FAM72CH0Y354 149 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ITGB1BP1O14713 200 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GPR182O15218 404 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 HNF1AP20823 631 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PRPS1L1P21108 318 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PTPN4P29074 926 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 LCN1P31025 176 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 DEFA6Q01524 100 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NME3Q13232 169 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PLA1AQ53H76 456 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FAM72BQ86X60 149 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZNF567Q8N184 647 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 BTBD9Q96Q07 612 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CYP2S1Q96SQ9 504 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RTKNQ9BST9 563 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZFP14Q9HCL3 533 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZBBXA8MT70 800 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 COPEO14579 308 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NXPH2O95156 264 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms