RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 PRR35P0CG20 571 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 SOX11P35716 441 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 ELK3P41970 407 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 AP1S2P56377 157 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 IL2P60568 153 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 DR1Q01658 176 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 NAE1Q13564 534 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 SYT16Q17RD7 645 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 LCTLQ6UWM7 567 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 OR9A4Q8NGU2 314 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 PRR7Q8TB68 274 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 PSMF1Q92530 271 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 CFAP36Q96G28 342 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.06■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 ANKUB1A6NFN9 424 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 BMP10O95393 424 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 DDAH2O95865 285 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 STATHP02808 62 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 HIST1H2ADP20671 130 aa22.05■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 HECTD2Q5U5R9 776 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 LINC00696Q6ZRV3 163 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 GPATCH11Q8N954 259 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 CAMKVQ8NCB2 501 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 TM4SF19Q96DZ7 209 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 CNDP1Q96KN2 507 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 PWWP2AQ96N64 755 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 HAUS8Q9BT25 410 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 MKL2Q9ULH7 1088 aa22.05■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 BCL6P41182 706 aa22.04■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 ABHD11Q8NFV4 315 aa22.04■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 C8orf89P0DMQ9 161 aa22.03■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 GRK3P35626 688 aa22.03■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 ARL4CP56559 192 aa22.03■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 AP2B1P63010 937 aa22.03■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 OR56A3Q8NH54 315 aa22.03■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 SARGQ9BW04 601 aa22.03■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 FEZF1A0PJY2 475 aa22.02■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 CCDC188H7C350 402 aa22.02■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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MBD3-211ENST00000592965 ATL1Q8WXF7 558 aa22.02■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 FBXL8Q96CD0 374 aa22.02■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 SNF8Q96H20 258 aa22.02■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 MACROD1Q9BQ69 325 aa22.02■■□□□ 1.12
MBD3-211ENST00000592965 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.02■■□□□ 1.12
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