RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CHID1Q9BWS9 393 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF358Q9NW07 568 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 SIX4Q9UIU6 781 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 B4DGG1 531 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 AHSA1O95433 338 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 CBR4Q8N4T8 237 aa8.25□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 RTP4Q96DX8 246 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 TAC3Q9UHF0 121 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.25□□□□□ -1.09
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