RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537335.5

POLR1B-216, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 4,961 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-216ENST00000537335 H1F0P07305 194 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ALAS2P22557 587 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 EDNRAP25101 427 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 MAP3K8P41279 467 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 SP140Q13342 867 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 FAM122BQ7Z309 247 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 SLC51AQ86UW1 340 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ACDQ96AP0 544 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ATG10Q9H0Y0 220 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 DNTTIP1Q9H147 329 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 MIOSQ9NXC5 875 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 OR10H1Q9Y4A9 318 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 CDC7O00311 574 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 OR7A17O14581 309 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 XKRYO14609 159 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 DRD5P21918 477 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 SLC2A5P22732 501 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 NMBRP28336 390 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 HTR1EP28566 365 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 GMPRP36959 345 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 C9orf64Q5T6V5 341 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 OR4N4Q8N0Y3 316 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 PARP16Q8N5Y8 322 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 MYLIPQ8WY64 445 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 HSH2DQ96JZ2 352 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 SLC29A1Q99808 456 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 CRB3Q9BUF7 120 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 TSSK6Q9BXA6 273 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 KCNMB3Q9NPA1 279 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 A8MT66 165 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 UBBP0CG47 229 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 GJA1P17302 382 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 CFL1P23528 166 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 MC4RP32245 332 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 TIGD3Q6B0B8 471 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ST7LQ8TDW4 575 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 FLRT1Q9NZU1 646 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 NME7Q9Y5B8 376 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 PRRG1O14668 218 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ECI2O75521 394 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 TP53P04637 393 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 SCARB2Q14108 478 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 DUSP26Q9BV47 211 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 CALML5Q9NZT1 146 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 LACTBL1A8MY62 500 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 TO15178 435 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 SLC22A5O76082 557 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 IFNA1P01562 189 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 PRKCGP05129 697 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 USP17L7P0C7H9 530 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 RAB4AP20338 218 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 HNF1BP35680 557 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 AIF1P55008 147 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 COQ5Q5HYK3 327 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 CES5AQ6NT32 575 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 STRADAQ7RTN6 431 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 LACC1Q8IV20 430 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 NETO2Q8NC67 525 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 OR6J1Q8NGC5 347 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 TAAR8Q969N4 342 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 KCNK13Q9HB14 408 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 J3QLW9 94 aa11.48□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 LRRTM2O43300 516 aa11.48□□□□□ -0.57
POLR1B-216ENST00000537335 IGSF6O95976 241 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms