RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CCR7P32248 378 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ADRA1AP35348 466 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CCNFP41002 786 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 XCR1P46094 333 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 BDKRB1P46663 353 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ITGA8P53708 1063 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 DLX5P56178 289 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 OR4D2P58180 307 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PLGLB1Q02325 96 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 TYRO3Q06418 890 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ABRAXAS2Q15018 415 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 NSDHLQ15738 373 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 GXYLT1Q4G148 440 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CMPK2Q5EBM0 449 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 VRK3Q8IV63 474 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 P3H2Q8IVL5 708 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 TMEM156Q8N614 296 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 AMER2Q8N7J2 671 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ARMC2Q8NEN0 867 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 OR51Q1Q8NH59 317 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SMC6Q96SB8 1091 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 NPAS2Q99743 824 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PLCD4Q9BRC7 762 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SPATA7Q9P0W8 599 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 HCN3Q9P1Z3 774 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PCYOX1Q9UHG3 505 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 DUSP10Q9Y6W6 482 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 OR14I1A6ND48 311 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 OR51F1A6NGY5 319 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ZNF839A8K0R7 811 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 INAFM1C9JVW0 142 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 H7C1Q1 480 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 CES2O00748 559 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 OR1I1O60431 355 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 NSA2O95478 260 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 GAS8O95995 478 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 SERPINC1P01008 464 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 TUBB4AP04350 444 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 TACR1P25103 407 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 RBL1P28749 1068 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 CDKN2BP42772 138 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 SLC1A1P43005 524 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 HLCSP50747 726 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 SLC26A5P58743 744 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 GPR85P60893 370 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 PPIAP62937 165 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 GRB7Q14451 532 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 SPARCL1Q14515 664 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 POU6F1Q14863 301 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 Q5PR19 223 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 SLC22A16Q86VW1 577 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 SULF2Q8IWU5 870 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 OR9A4Q8NGU2 314 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 PANX3Q96QZ0 392 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 TTYH2Q9BSA4 534 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 YIPF4Q9BSR8 244 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 BDH2Q9BUT1 245 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ANKHQ9HCJ1 492 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 PNPLA3Q9NST1 481 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 TAC3Q9UHF0 121 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 CBLCQ9ULV8 474 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.77□□□□□ -1.49
CBX1-205ENST00000495350 ARID1AO14497 2285 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms